新来的秘书完结泰国讲述的是：巧克力甜点师辻元先生在世界大赛上获奖的巧克力让小兰和园子非常期待，而辻元和他的美女店铺设计师真悠子小姐的浪漫爱情也让很多人憧憬。铃木财团的协助让辻元的店铺将在明天开业，而园子和小兰则是这个店铺的第一组客人，在辻元展示自己获奖的作品时发生了意外，这并不是一起普通的事故，柯南已经看出被烈焰所包裹的巧克力背后的隐情。